DETECTR: uma nova forma de detecção rápida, sensível e específica do novo coronavírus SARS-CoV-2 baseada em CRISPR
Avanços recentes em diagnósticos baseados em CRISPR sugerem que DETECTR, uma combinação de amplificação isotérmica mediada por loop com transcriptase reversa (RT-LAMP, do inglês Reverse transcription loop-mediated isothermal amplification) e subsequente ativação de nuclease do observador Cas12 por amplicon direcionado a complexos de ribonucleoproteína, poderia ser uma alternativa mais rápida e mais barata para o qRT-PCR1 sem sacrificar sensibilidade / especificidade.
Nesse estudo, publicado pelo The Journal of Infectious Diseases, comparou-se o DETECTR com o qRT-PCR1 para diagnosticar COVID-19 em 378 amostras de pacientes.
Os ensaios de diluição da amostra do paciente sugerem uma sensibilidade analítica mais alta de DETECTR em comparação com qRT-PCR1, no entanto, isso não foi confirmado nesta grande coorte2 de pacientes, onde relatou-se reprodutibilidade de 95% entre os dois testes. Esses dados mostraram que ambas as técnicas são igualmente sensíveis na detecção de SARS-CoV-2, fornecendo valor adicional de DETECTR para as plataformas de qRT-PCR1 usadas atualmente.
Para DETECTR, diferentes gRNAs podem ser usados simultaneamente para evitar resultados negativos devido a mutações no gene N. Faixas de fluxo lateral, adequadas como um teste no ponto de atendimento, mostraram uma correlação de 100% com o ensaio DETECTR de alto rendimento. É importante ressaltar que o DETECTR foi 100% específico para SARS-CoV-2 em relação a outros coronavírus humanos.
Como não há necessidade de equipamento especializado, o DETECTR pode ser rapidamente implementado como uma abordagem complementar tecnicamente independente para qRT-PCR1, aumentando assim a capacidade de testes de laboratórios microbiológicos3 médicos e liberando as plataformas de PCR1 existentes para testes diagnósticos de rotina que não do SARS-CoV-2.
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Fonte: The Journal of Infectious Diseases, publicação em 10 de outubro de 2020.